水肥一体化系统的常用形式以滴灌、喷灌与施肥结合较多。灌溉设备的选择应根据农户要求、作物类型、土壤情况、水源地情况等来定，现有智慧水肥一体化设备，可以根据作物实时需求实现自动灌溉。施肥装置需根据作物类型、作物面积、地形等来选择，常见的装置有压差式施肥罐、开敞式施肥罐、文丘里注入器及注射泵等。过滤设备需根据水源情况来选择，常见的设备有旋流式水砂分离器、砂过滤器、筛网过滤器和叠片式过滤器等。
灌溉系统的布设是一个重要和复杂的系统工程，需要综合考虑作物种类、地形、水源、灌溉设备等，干、支管的布置形式取决于地形、水源、作物分布和毛管的布置，达到管理方便、工程投资少的目的。在山丘地区，干管多沿山脊布置，或沿等高线布置。支管垂直于等高线向两侧的毛管配水。在水平地区，干、支管应尽量双向控制，两侧布置下级管道，以节省管材。毛管和灌水器的布置形式主要取决于作物种类和所选用灌水器的类型。
作物如何灌溉，需要根据作物生长期的需水规律、土壤含水量、土壤性质、作物根系情况等来确定，制定合理的灌溉制度，确定作物每个生长阶段的灌溉水量、灌溉次数、时间...比如，目前发展比较成熟的智慧灌溉系统便可根据专家数据库来确定合适的灌溉方案，然后由水肥一体化设备进行自动执行。
一般复合肥不溶性营养成分多，杂质多，极易堵塞过滤系统。因此水肥一体化系统所用肥料需要满足溶解度高、溶解速度快、与灌溉水相互作物小等要求，避免对喷头或滴头造成堵塞。不同的作物需要不同数量的肥料。即使是一种作物，在不同的生长时期也需要不同数量的相同元素。因此，我们需要根据作物在每个生长阶段的实际需要来匹配营养元素。
把握好水肥的浓度：很多肥料本身都是无机盐，如果溶度过高，那么就会造成农作物的烧伤。因水肥的浓度一定要的安装标准，最精确的方法是测定从滴落头施用或出口的肥料的导电性。一般来说，1.0-3.0ms/cm的范围是安全的。或许水溶性肥料稀释400-1000倍，或许每方水参与1-3公斤水溶性复合肥喷洒是安全
需要做好日常维护：水肥一体化设备，本身管道都是地埋式的，每次灌溉结束后都需要对于管道做个检查，检查有没有管道破损等情况，心维护才能发挥最佳性能冲洗地埋管和空水，清洗并覆盖第一设备，只有这样才能保证下次正常使用。
保护水肥一体化设备过滤器：这个是非常重要的，过滤器主要的作用是过滤灌溉水当中的一些泥沙，因为一般来说滴灌的孔径非常细小，很小的泥沙都可能堵塞灌溉孔，如果过滤器失去了作用，那么很可能会导致整个灌溉系统的瘫痪，因此使用
水肥一体化设备，一定要做好过滤器的保护。
